Pada tahun 1983 Dinas Perikanan Kabupaten Barru masih dalam berbentuk resort yang di gabungkan dengan Rupat karena Kabupaten Barru saat itu masih berada di bawah naungan Pemerintah Kabupaten Bengkalis dan Kabupaten Barru masih di sebut kota administratif, setelah itu pada tahun 1999 Kabupaten Barru menjadi kota madya berdasarkan UU No.16 Tahun 1999 tanggal 20 April 1999 (Lembaran Negara Tahun 1999 Nomor 50, tambahan Lembaran Negara Nomor 3829), Barru berubah status menjadi Kotamadya sehingga menjadi Kotamadya Dati. II Barru. Seiring perkembangan politik di Indonesia, berdasar UU No. 22 Tahun 1999 maka Kotamadya Barru berubah menjadi Kabupaten Barru.

Kepala Dinas Perikanan Kabupaten Barru pertama adalah Ir. Ramli Muhammad Ali, dan berkantor Di Jalan Cendrawasih di Sekolah Perikanan yang sekarang menjadi SMK Perikanan Provinsi Riau. Kemudian pada tanggal 4 Oktober 1999 Dinas Perikanan berpindah ke Jalan Sukajadi karena sudah adanya Rencana Kegiatan dan Anggaran (RKA) sendiri, dimasa Pemerintahan Kabupaten Barru dipimpin oleh Drs. H. Zainuddin Abdullah. Pada tahun 2002 Dinas Perikanan Kabupaten Barru berpindah ke Purnama, Kabupaten Barru Barat di Jalan Dermaga bekas Kantor Tranmigrasi Kota dengan kepala dinasnya bernama Ramli Amir, SH. (sumber : Syarifuddin dan Jafri,SST. PNS Dinas Perikanan Kabupaten Barru)

Seiring berjalannya waktu dan berdasarkan Peraturan Daerah Kabupaten Barru Nomor 14 Tahun 2005 Tentang Pembentukan Organisasi dan Tata Kerja Dinas Peternakan, Perikanan dan Kelautan Kabupaten Barru, Peraturan Walikota Nomor 16 Tahun 2008 tanggal 11 September 2008 Tentang Organisasi dan Tata Kerja Dinas Daerah, Dinas Perikanan Kabupaten Barru bernama Dinas Peternakan, Perikanan dan Kelautan Kabupaten Barru dan berganti menjadi Dinas Perikanan Kabupaten Barru berdasarkan Peraturan Daerah Kabupaten Barru Nomor 12 Tahun 2016 Tentang Pembentukan dan Susunan Perangkat Daerah Kabupaten Barru dan Susunan Perangkat Daerah Kabupaten Barru dan Peraturan Walikota Nomor 64 Tahun 2016 tentang Kedudukan, Susunan Organisasi, Tugas dan Fungsi Serta Tata Kerja Dinas Perikanan Kabupaten Barru.